カコモンノート

問115薬剤師 第103回

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第103回

ある DNA の塩基配列をジデオキシ法により解析し、図のような実験結果を得た。また、表(制限酵素一覧)を参照して、その配列中の制限酵素部位の同定を行った。

資料
【ジデオキシ法の原理】
DNA ポリメラーゼによる相補鎖 DNA 合成の際に、その基質である 4 種類のデオキシリボヌクレオシド三リン酸(dNTP:N は A、G、C 又は T)に加え、 4 種類のジデオキシリボヌクレオシド三リン酸(ddNTP:N は A、G、C 又は T)のうち、それぞれ 1 種類だけを用いて特異的に DNA 合成を停止させる。その結果、A、G、C 又は T で特異的に終わる様々な長さの DNA 断片が合成され、これら断片をポリアクリルアミドゲル電気泳動により分離することで、DNA の塩基配列を解読できる。
【実験方法】
鋳型 DNA 鎖にプライマー DNA 断片を結合させ、dATP、dGTP 及び dTTP と放射性同位体元素で標識した dCTP を加えた。この反応溶液に ddATP、ddGTP、ddCTP 又は ddTTP を別々に加えて、標識相補鎖 DNA を合成した。次にこれら 4種類の反応溶液をポリアクリルアミドゲル電気泳動に供じた。泳動後、乾燥したゲルを X 線フィルムに密着させ、-80 ℃で一晩放置した。
【実験結果】
DNA 断片は放射標識されていることから、X 線フィルム上ではしご階段状の泳動像(オートラジオグラフィー)として検出された(図)。
X 線フィルム上で解読した DNA 配列及び実験方法に関する記述のうち、正しいのはどれか。2つ選べ。
この問題の図
問題に添えられた図。出典は下に書いています。

2つえらぶと、答えと解説が出ます

2つえらぶと、
ここに答えと解説が出ます
正答 1・4

解説

正解は1と4です。ddNTPは3ʼ位にOH基が無いので次のヌクレオチドとつながれず、そこで伸長が止まります。電気泳動では短い断片ほど陽極側へ進むので、図の下のバンドから上へ順に読むと、合成鎖は5ʼ-CGCGAATTCTGG-3ʼとなり、EcoR Iの認識配列GAATTCを含みます。Kpn IのGGTACCは見当たらないので5は誤りです。5ʼ末端から5番目はA、3ʼ末端から4番目はCなので、2と3も誤りです。

KEY POINT
短い断片ほど陽極側→下のバンドから読むと5ʼ→3ʼの配列
出典:厚生労働省「第103回薬剤師国家試験」問題(第2分冊)(厚生労働省)
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